Angriparna beskrivs som "beväpnade terrorister".
Burkina Faso – ett av världens fattigaste länder – befinner sig i frontlinjen för det jihadistiska upproret i det västafrikanska Sahelområdet.
Kristna och kyrkor i de norra delarna av landet har ofta blivit måltavlor för våldet.
Pastorn mördades
Så sent som den 10 februari kidnappade misstänkta jihadister sju personer i ett angrepp mot en pastors bostad i staden Sebba. Tre dagar senare hittades fem av dem, inklusive pastorn, mördade.
Enligt FN-siffror dödades runt 1 800 civila i terrorattacker i Burkina Faso i fjol. Samtidigt har hundratusentals under de senaste åren flytt sina hem.
Om grannländerna Mali och Niger inkluderas stiger dödssiffran för jihadistiska terrordåd till närmare 4 000 under 2019.
"Förödande ökning"
Motsvarande siffra 2016 var 770 döda.
– Regionen har upplevt en förödande ökning av terroristattacker mot civila och militära mål, säger Mohamed Ibn Chambas, FN:s särskilde sändebud fför Västafrika och Sahel, till FN:s nyhetsbyrå.
Pansi ligger i norra Burkina Faso.