Attacken skedde enligt det afrikanska landets säkerhetsstyrkor i samma område som flera dödliga angrepp med islamistiska förtecken ägt rum det senaste året.
Offren deltog i en gudstjänst i en protestantisk kyrka i orten Hantoukoura nära gränsen mot Niger och enligt vittnen var det cirka tio "kraftigt beväpnade individer" som genomförde attacken.
Bestört över ännu en attack mot bedjande människor. Nu i en kyrka i Burkina Faso under söndagens gudstjänst. Rapporter om många döda. Gud, omslut alla drabbade!
— Antje Jackelén (@BiskopAntje) December 2, 2019
Burkina Faso utsätts återkommande för attacker. Väpnade islamistgrupper som härjar i flera länder i regionen i stort har spillt över Burkina Fasos gränser. Hundratals civila har dödats och tiotusentals har tvingats på flykt i år.